專業(yè)不同
1、區(qū)域一流大學(xué)：區(qū)域一流大學(xué)大部分的專業(yè)是一流。
2、區(qū)域高水平大學(xué)：區(qū)域高水平大學(xué)少部分的專業(yè)是一流。
級別不同
1、區(qū)域一流大學(xué)：區(qū)域一流大學(xué)的級別較高，受到國家財政長期重點投入、重點支持、重點傾斜、重點建設(shè)。
2、區(qū)域高水平大學(xué)：區(qū)域高水平大學(xué)的級別較低，通過“雙一流”、“特色重點學(xué)科項目”、“省部共建大學(xué)”、“2011計劃”、“部省合建大學(xué)”等國家層面的工程建設(shè)提升為區(qū)域一流大學(xué)。