學(xué)校建于2001年，前身為北京師范大學(xué)珠海教育園區(qū)（也稱北京師范大學(xué)珠海校區(qū)），2003年7月更為現(xiàn)名。
按教育部教發(fā)函[2019]14號文件，北京師范大學(xué)珠海分校將從2019年起逐年調(diào)減招生計劃，于2021年停止招生，2024年終止辦學(xué)。北京師范大學(xué)將在廣東省政府、珠海市政府的支持下，利用北京師范大學(xué)珠海分校以及已協(xié)議收回的北京師范大學(xué)—香港浸會大學(xué)聯(lián)合國際學(xué)院的用地、校舍建設(shè)北京師范大學(xué)珠海校區(qū)。