學院設(shè)有作物學博士后流動站、作物學一級學科博（碩）士點，作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種、植物生物技術(shù)、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全與環(huán)境、農(nóng)業(yè)信息化技術(shù)、區(qū)域農(nóng)業(yè)發(fā)展、作物生產(chǎn)裝備及其自動化等7個二級學科博（碩）士點和生態(tài)學二級學科碩士點，以及農(nóng)業(yè)推廣碩士專業(yè)學位點（含作物、農(nóng)村與區(qū)域發(fā)展2個培養(yǎng)領(lǐng)域）；學院設(shè)有農(nóng)學、農(nóng)村區(qū)域發(fā)展2個本科專業(yè)和農(nóng)學（農(nóng)業(yè)信息技術(shù)）專業(yè)方向，其中農(nóng)學專業(yè)為江蘇省首批品牌專業(yè)和國家特色專業(yè)建設(shè)點，農(nóng)村區(qū)域發(fā)展專業(yè)是揚州大學特色專業(yè)建設(shè)點。
重點學科：作物栽培學與耕作學，為國家級重點學科，發(fā)源于1902年著名實業(yè)家、教育家張謇先生創(chuàng)辦的江海農(nóng)學堂。20世紀60年代開始招收研究生，1981年獲碩士學位授予權(quán)，1998年獲博士學位授予權(quán)，2000年獲作物學一級學科博士學位授予權(quán)，2003年獲準設(shè)立作物學博士后流動站。1986年、1994年、2001年相繼被確定為江蘇省重點學科，2006年被評為國家級重點學科。其中，農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全及其控制方向于2005年被遴選為江蘇省重點（交叉）學科。1996年后，一直為中國作物學會栽培專業(yè)委員會掛靠單位。